SA-BLASTonGT

(1)

ローカルでのBLAST

BLASTをローカルに実行することができるので、処理、結果表示のカスタマイズや、独自のデータベースによる検索が可能となる。

(2)

NCBI-BLASTを使用

標準のNCBI-BLASTを使用しているので、NCBIで実行させた結果と同一性が維持される。また、NCBIでBLASTがバージョンアップされた際にも、NCBIのサイトからダウンロードして、そのまま使用することが可能。他の独自のBLASTプログラムを実行させることは、設定ファイルを書き換えることにより可能となる。

(3)

GUI環境での実行

BLASTをコマンドモードではなく、GUI環境で使用することができ、その場合でもNCBI-BLASTのパラメータを指定することにより、感度等の細かな設定が可能となる。また検索シーケンスの指定を、マルチFASTA 形式で入力されたファイルで指定することも可能。

(4)

稼働環境

当面下記のOS上で稼働し、異機種混在の環境でも動作可能。
 ・Windows 98/98SE/Me/XP、Windows 2000
 ・Linux Red Hat 7.3/8.0/9.0

将来的には、
 ・Solaris 2.6/7/8
 ・Mac OS X
等のOSに対応予定。

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